Fen Bilimleri Enstitüsü, 01.03.2006 tarihinde kabul edilerek 17/03/2006 tarih ve 26111 sayılı Resmi Gazete yayınlanan, 5467 nolu Kanunun Ek 65.Maddesi hükmünce kurulan, Giresun Üniversitesi bünyesinde oluşturulmuştur. 2547 sayılı Yükseköğretim Kanununa dayanılarak çıkarılmış olan “Lisansüstü Eğitim Öğretim Yönetmeliği”nde belirtilen mevzuat usul ve esaslara göre işlevini yürütmektedir.